开发深度学习设计模型

大多数深度学习模型仍主要用于单链骨架的设计，难以充分应对更复杂的蛋白-蛋白相互作用（protein-protein interaction, PPI）设计挑战。为此，复旦大学药学院戚逸飞/王任小团队开发了专门用于PPI界面序列设计的模型——ProBID-Net。该模型能够根据给定的受体蛋白结构，预测配体蛋白界面上的氨基酸序列，并在多项测试中展现了优良的性能。近日，该项研究成果在线发表于Chemical Science期刊。