1949年10月1日，新中国诞生了，陈望道全身心地投入百废待兴的各项工作中，特别是为接管旧复旦作出了重大贡献。
8月1日《新华日报》报导了上海市军事管制委员会陈毅主任、粟裕副主任签署的命令，命令云：“兹派张志让、陈望道、卢于道、周谷城、潘震亚、章靳以、章益、胡曲园、张薰华等15人为国立复旦大学校务委员会常务委员，张志让为主任委员，陈望道为副主任委员”，由于张志让主任此时已经去北平另有安排，陈望道义不容辞地带领校委会全体成员，配合军管会代表李正文，实现了对旧复旦大学的接管。
他做的第一件事是，让在解放前夕因遭受国民党当局迫害而离校的师生返校复职和复学；第二件事是，根据市里的统一安排，在1950年进行了第一次院系调整；第三件事，在校务委员会上建议並通过了以上海解放日（5月27日）作为新复旦的校庆日。
之后，校务委员会又续聘和新聘了一大批学有专长的教授学者，如：冯雪峰、唐弢、李健吾、徐铸成、刘佛年、陆诒、倪海曙、周有光等，以充实学校师资力量。接着逐步调整了院、系两级的领导班子。为集中精力搞好校务委员会的领导工作，陈望道自己辞去了文学院院长、新闻系主任的兼任职务，另聘恽逸群为新闻系主任。
1949年底，为配合新中国成立后的爱国主义思想教育运动，复旦大学校务委员会专设了政治学习委员会。之后，学校为了提高全校教职员的马列主义理论水平，又设立了马列主义研究会，并暂时决定开设辩证唯物论、历史唯物论、社会发展史和政治经济学四门课程。
为把复旦大学办成真正的人民最高学府，实现从旧大学到新大学的转变，以陈望道为首的校务委员会在党组织的领导下，从1951年开始推行集体教学制度的办法，建立了在系主任领导下的教学组织——学科教学研究组（简称教研组），并责成各系科制定教学计划和教学大纲，由系主任督促检查教学计划的执行。为了加强全校的图书管理，校务委员会还下设了专门的图书委员会。并从这一年始，带领全校师生投入为建立新复旦大学的各项运动中。
在1949——1952年陈望道受命接管复旦大学的日子里，他几乎主持了全部校务委员会的常委会议和全体委员会议，主管着学校的一切行政事务。为整顿和恢复正常的教学秩序，他实行了多项教学和行政管理方面的改革，并带领全校师生参加了一系列的政治运动。他还十分重视文书档案的建设，由于陈望道对学校档案建设的重视，复旦大学文书档案室至今还完好保存着全部的文书档案。
