近期，复旦上医科研团队取得了多项突破。敲黑板！一起看看2024年4月的科研成果吧~
以下成果据学校、上海医学院官网等整理。
2024.4 科研成果一览
诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno
2024年4月2日，复旦大学脑科学研究院诸颖团队，在《自然-通讯》（Nature Communications）上发表了题为《Pianno：为空间转录组学自动进行语义注释的概率框架》（Pianno: a probabilistic framework automating semantic annotation for spatial transcriptomics ）的研究成果。作者开发了空间转录组语义注释工具Pianno，能够为组织内的空间点自动定义结构或细胞类型，从而结合来自多个维度的信息，加强对复杂生物系统的解释。
论文地址：https://doi.org/10.1038/s41467-024-47152-4
王红霞团队揭示乳腺癌化疗耐药“元凶”如何形成 “新亚群”细胞诱导化疗“失效”
2024年4月3日，复旦大学附属肿瘤医院王红霞团队在Science Translational Medicine上发表了题为“TSPAN8+ myofibroblastic cancer–associated fibroblasts promote chemoresistance in patients with breast cancer”研究成果。在肿瘤微环境中首次鉴定出一种名为“TSPAN8+ myCAFs”的成纤维细胞耐药新亚群，与化疗失效密切相关。基于这一重大发现，团队开发了靶向TSPAN8-SIRT6信号的联合治疗策略，破解患者化疗耐药难题。
论文地址：https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.adj5705
范小勇等团队揭示亚油酸代谢介导不同卡介苗菌株诱导训练性免疫的异质性
2024年4月5日，上海市重大传染病和生物安全研究院、上海市公共卫生临床中心和深圳国家感染性疾病临床医学中心的范小勇/卢水华/胡志东研究团队在《科学进展》（Science Advances）上发表题为“Multi-omics analysis reveals linoleic acid metabolism is associated with variations of trained immunity induced by distinct BCG strains”的研究性文章。作者综合利用小鼠和巨噬细胞训练性免疫模型比较了不同BCG菌株诱导训练性免疫能力的差异，然后通过多组学分析揭示了巨噬细胞亚油酸代谢参与介导了这种异质性。研究结果不仅揭示了不同BCG菌株诱导训练性免疫的代谢机制，也为靶向提高BCG诱导训练免疫能力提供了一种新思路。
论文地址：https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adk8093
黄忠/梁小珍团队在柯萨奇病毒B4型疫苗研发中取得进展
2024年4月5日，上海市重大传染病和生物安全研究院黄忠团队与中国科学院上海免疫与感染研究所梁小珍团队共同在学术期刊Emerging Microbes& Infections上发表题为“Immunogenicity and protective efficacy of inactivated coxsackievirus B4 viral particles” 的研究论文，该论文报道了基于CVB4灭活病毒颗粒的候选疫苗的制备、免疫原性和保护效力，并且揭示了中和抗体在体内抗病毒保护中发挥关键作用。
论文地址：https://doi.org/10.1080/22221751.2024.2337665
黄锦海/周行涛等团队合作揭示角膜新生血管治疗原创突破
2024年4月6日，复旦大学附属眼耳鼻喉科医院黄锦海/周行涛团队与暨南大学附属深圳眼科医院雷和田团队、温州医科大学附属眼视光医院王勤美团队携手合作，在学术期刊《先进科学》（Advanced Science）上发表论文《基因编辑VEGFA阻止在体角膜新生血管生成》（Genome Editing VEGFA Prevents Corneal Neovascularization In Vivo）。角膜新生血管的形成会不断侵蚀角膜的透明性，导致患者视力大幅下降。研究团队聚焦眼科医工交叉研究，充分发挥基因编辑等多学科技术优势，采用基因编辑“剪”断促新生血管形成的关键环节，实现一针“剪”血的治疗效果，为维持角膜透明与健康的生理状态起到重要作用，为角膜新生血管的治疗带来新突破。
论文地址：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/advs.202401710
邓强团队揭示乙肝病毒核心蛋白促进肝细胞损伤机制
2024年4月8日，复旦大学基础医学院医学分子病毒学教育部/卫健委/医科院重点实验室暨病原生物学系邓强联合多团队，在Science Bulletin杂志发表题为“Hepatitis B virus core protein as a Rab-GAP suppressor driving liver disease progression”的研究成果。研究者基于HBV重症肝炎相关BCP突变株建立转基因小鼠，与早期报道的野生病毒转基因模型显著不同的是，BCP突变株转基因小鼠具有典型的肝细胞慢性损伤特征，伴随肝硬化和肿瘤发生等进展性病理变化。
论文地址：https://doi.org/10.1016/j.scib.2024.04.014
陆豪杰/张莹团队开发活细胞表面功能性氨基酸位点发现新方法
针对细胞表面高反应性氨基酸的分析，复旦大学化学系/生物医学研究院/卫健委糖复合物重点实验室陆豪杰/张莹团队开发了一种全新的活细胞表面功能氨基酸分析的化学蛋白质组学方法。2024年4月8日，相关研究成果以“A chemical proteomics approach for global mapping of functional lysines on cell surface of living cell”为题发表于《自然-通讯》（Nature Communications）杂志，用于全局性鉴定活细胞表面的功能性赖氨酸。
论文地址：https://www.nature.com/articles/s41467-024-47033-w
姜世勃/陆路/徐巍团队证明含红藻凝集素G和通用冠状病毒融合抑制剂的重组蛋白（GL25E）能高效广谱抑制流感和新冠病毒共感染
2024年4月9日，上海市重大传染病和生物安全研究院/复旦大学基础医学院的姜世勃/陆路/徐巍团队在mBio上在线发表了题为“Inhibition of influenza A virus and SARS-CoV-2 infection or co-infection by griffithsin and griffithsin-based bivalent entry inhibitor”的研究论文。本研究证明GRFT和GL25E均能有效地抑制H7N9和H5N1流感假病毒以及H3N2和H1N1流感活病毒的感染，在小鼠体内也表现出较好的预防和治疗H1N1感染的有效果和安全性。作用机制研究证明GRET和GL25E都能够作用于流感病毒HA1蛋白上的糖基化位点来抑制IAV感染，而GL25可同时作用于新冠病毒S1亚基上的糖基化位点和S2亚基中HR1区，能更有效地抑制新冠病毒及其变异株的感染和新冠病毒与流感病毒的共感染。此外，GL25E显示出较好的稳定性、长效性和动物体内的安全性等成药性特征，有望被开发成为安全、有效的广谱抗病毒药物或医疗产品，防控未来新发与再现的冠状病毒和流感病毒的单感染或共感染。
论文地址：https://doi.org/10.1128/mbio.00741-24
姚瑜教授团队及合作者联合开发研究脑胶质瘤微环境的新技术
2024年4月9日，国家神经疾病医学中心、复旦大学附属华山医院姚瑜团队联合上海中医药大学汤忞在《细胞发现》（Cell Discovery）期刊上发表了题为《整合3D生物打印和多算法机器学习重现脑胶质瘤的易感性和微环境特征》（Integration of 3D bioprinting and multi-algorithm machine learning identified glioma susceptibilities and microenvironment characteristics）的研究论文。该研究建立了人工智能融合模型GlioML，能够高度重现肿瘤的分子/微环境特征，是一种可应用于将来药物筛选、免疫治疗评估以及相关机制研究的创新体系。
论文地址：https://www.nature.com/articles/s41421-024-00650-7
许杰团队发现CD3L1免疫检查点，为肿瘤治疗带来新突破
2024年4月12日，复旦大学生物医学研究院许杰团队在《细胞》（Cell）杂志发表题为“ITPRIPL1 binds CD3ε to impede T-cell activation and enable tumor immune evasion”的研究论文，发现CD3的首个配体CD3L1（或 ITPRIPL1），揭示了CD3L1在肿瘤免疫逃逸与睾丸免疫豁免中的关键作用。这是肿瘤免疫治疗的全新靶点CD3L1抗体首次被报道，有望为肿瘤免疫治疗带来新的突破。
相关文章链接：https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.03.019
蒋晨团队揭示多模块递释系统干预肿瘤和免疫细胞之间合作,用于三阴性乳腺癌治疗
肿瘤细胞、邻近免疫细胞和各种免疫细胞类型之间的复杂相互作用涉及通过代谢和免疫信号连接的复杂“竞争-合作模式”，这对形成免疫抑制肿瘤微环境（TME）至关重要。在难治三阴性癌症（TNBC）中，这种代谢失衡、免疫抑制性微环境发挥着至关重要的作用，导致疾病的不良预后。2024年4月12日，复旦大学药学院蒋晨团队设计了一种基于细菌外膜囊泡（OMV）的多模块递释系统，通过独特地利用电荷反转聚合物的性质来实现功能分离，用于特异性靶向恶性细胞和免疫细胞，以定向调和基于代谢免疫串扰的关系，恢复免疫细胞抗肿瘤活性。相关成果以“Reconciling the Cooperative-Competitive Patterns Among Tumor and Immune Cells for Triple-Negative Breast Cancer Treatment Using Multimodule Nanocomplexes”为题，在线发表于《先进材料》（Advanced Materials） 。
论文地址：https://doi.org/10.1002/adma.202312219
王晓川/孙金峤团队揭示APDS1患者发生自身免疫现象机制
2024年4月18日，复旦大学附属儿科医院王晓川/孙金峤团队在Journal of Clinical Immunology上发表了题为“Phenotypic and Immunological Characterization of Patients with Activated PI3Kδ Syndrome 1 Presenting with Autoimmunity”的研究论文。该研究分析了APDS1患者的临床及免疫特征，并揭示了发生自身免疫现象的机制。
论文地址：https://link.springer.com/article/10.1007/s10875-024-01705-w
程净东团队揭示肿瘤抑制因子PDCD4抑制细胞翻译起始的新机制
2024年4月19日，复旦大学生物医学研究院程净东团队在《细胞研究》（Cell Research）在线发表了题为“Human tumor suppressor PDCD4 directly interacts with ribosomes to repress translation”的研究论文。这项最新的研究聚焦一类重要的肿瘤抑制因子——PDCD4，并详细阐明了其在翻译调控过程中发挥的新作用机制。
论文地址：https://www.nature.com/articles/s41422-024-00962-z
马丽香/赛音贺西格团队合作发现突变亨廷顿蛋白改变大脑皮层的发育轨迹
2024年4月23日，复旦大学基础医学院马丽香与生命科学学院赛音贺西格联合团队在应用脑类器官研究HD疾病新的机制方面取得了新进展，相关研究成果以“Endogenous mutant Huntingtin alters the corticogenesis via lowering Golgi recruiting ARF1 in cortical organoid”为题在线发表在《分子精神病学》（Molecular Psychiatry）杂志上。该研究首先利用HD患者多能干细胞衍生的皮层类器官（hCO）模拟了HD胎儿大脑皮质的改变，包括神经管中的连接复合体缺陷、有丝分裂后神经元成熟延迟、皮质神经元亚型的命运规范失调以及皮质发生过程中早期HD皮质下投射的异常。上述病理表型与HD胚胎样本病理表型高度吻合，也提示了HD大脑中受损的神经前体细胞与混乱的皮质神经元分层之间可能的因果联系。
论文地址：https://doi.org/10.1038/s41380-024-02562-0
王鹏团队/孟志强团队联合揭示溶瘤腺病毒有效抑制肿瘤腹膜种植转移与恶性腹水产生
晚期的消化系统肿瘤，尤其是胆管和胰腺肿瘤，通常会伴有腹膜种植转移，进而引发严重的恶性腹水。这种情况下，各种抗肿瘤治疗的效果均十分有限，严重影响到患者的生活质量并缩短了生存期，且至今尚无特效药物治疗这一病症。因此，寻找有效的治疗手段是临床中亟待解决的问题。2024年4月23日，复旦大学附属中山医院王鹏团队联合复旦大学附属肿瘤医院孟志强团队在美国基因与细胞治疗学会ASGCT的会刊《分子治疗》中发表了题为《溶瘤腺病毒治疗恶性腹水：一项II期临床试验及纵向单细胞研究》（Oncolytic adenovirus in treating malignant ascites: a phase II trial and longitudinal single-cell study）的研究论文，系统评估了溶瘤腺病毒治疗胆管/胰腺/卵巢肿瘤并发恶性腹水的疗效和安全性。
论文地址：https://www.cell.com/molecular-therapy-family/molecular-therapy/fulltext/S1525-0016(24)00252-1
杨力团队合作利用环形RNA适配体在小鼠模型实现银屑病的干预治疗研究
2024年4月23日，复旦大学附属儿科医院/复旦大学生物医学研究院杨力团队在高效制备环形RNA适配体做为新型RNA药物开展银屑病疾病模型干预治疗的领域取得重要合作研究进展，相关合作成果发表以“Therapeutic application of circular RNA aptamers in a mouse model of psoriasis”为题发表在《自然-生物技术》（Nature Biotechnology）上。科研人员优化RNA自剪接体外成环新策略，实现大规模合成低免疫原性且具有特殊双链结构的环形RNA适配体（short double-stranded region-containing circular RNAs, ds-cRNAs），探究其用于治疗PKR相关免疫疾病的分子基础和潜能，并最终通过靶向递送实现了利用环形RNA对银屑病小鼠模型的干预治疗，为新型环形RNA药物的开发奠定了理论基础和技术依据。
论文地址：https://www.nature.com/articles/s41587-024-02204-4
葛均波/孙爱军团队在缺血性心脏病机制研究方面再获突破！
4月26日，复旦大学附属中山医院葛均波、孙爱军团队与福建省立医院郭延松团队合作，在《欧洲心脏杂志》 (European Heart Journal) 上发表了题为《乙醛脱氢酶2缺失介导中性粒细胞胞外诱捕网形成加重心肌缺血再灌注损伤而该过程可以被白三烯C4抑制剂所改善》（Myocardial reperfusion injury exacerbation due to ALDH2 deficiency is mediated by neutrophil extracellular traps and prevented by leukotrience C4 inhibition）的研究成果。该研究揭示了因乙醛脱氢酶2基因缺失而加重心肌缺血再灌注损伤的机制，即通过内质网应激/微粒体谷胱甘肽S转移酶2/白三烯C4信号通路介导中性粒细胞胞外诱捕网形成（NETosis）。研究团队发现一种使用抗哮喘类药物阻断以上机制发生的新策略，对防治心肌缺血再灌注损伤的治疗带来较好的临床转化前景。
论文地址：https://doi.org/10.1093/eurheartj/ehae205
王菲菲团队发现海马痕迹神经元Rac1和自噬调控因子在条件恐惧记忆提取中的作用
2024年4月28日，复旦大学基础医学院王菲菲团队在《脑，行为和免疫》（Brain Behavior and Immunity）期刊发表题为“Destabilization of fear memory by Rac1-driven engram-microgliacommunication in hippocampus”的研究成果。该研究以痕迹神经元与小胶质细胞相互作用为切入点，解析了背侧海马齿状回（DG）记忆痕迹神经元Rac1-ATG7（自噬相关蛋白7） 通路与小胶质细胞 TLR2/4（Toll样受体2/4）之间的信号传递能够特异性地调控场景恐惧记忆。
论文地址：https://doi.org/10.1016/j.bbi.2024.04.024
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