开发通讯知识库MACC

作者:摄影: 视频: 来源:生命科学学院发布时间:2023-11-28


日前,生命科学学院曹志伟教授课题组联合同济大学唐凯临副教授团队,合作开发了首个代谢物介导的细胞-细胞间通讯知识库MACCMACC 1.0聚焦于人类内源性代谢物,基于文献挖掘算法筛选了约150万篇与代谢物相关的研究论文,经多轮人工校验后整合为高质量代谢物介导的细胞相互作用,收录了细胞间通过代谢物的分泌和吸收进行远程通讯的信息,以及由此对靶细胞产生的下游生物功能注释。MACC作为配体-受体介导的细胞间相互作用关系的有力补充,为解析细胞间通讯提供新的视角。该成果以“MACC: a visual interactive knowledgebase of metabolite-associated cell communications”为题发表在学术期刊Nucleic Acids Research上。


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