日前，复旦大学生物医学研究院/附属肿瘤医院陈飞课题组与浙江大学陆华松课题组合作，在《自然》（Nature）杂志以长文形式发表了文章R-loop dependent promoter-proximal termination ensures genome stability (《R-loop依赖的启动子近端转录早期终止维持基因组稳定性》)。该研究首次发现了INTAC复合物与单链DNA识别复合物SOSS稳定结合并形成SOSS-INTAC复合物；该复合物以凝聚体的形式通过调控细胞内R-loop的水平维持基因组稳定性。
高等生物中，由RNA聚合酶II (Pol II)介导的转录是一个高度动态的过程，包括了转录起始、启动子近端暂停、延伸和终止等步骤。完成转录起始的Pol II会在转录起始位点(TSSs)下游200 bp的窗口内发生短暂暂停，并面临两种命运选择——走向有效延伸或者在启动子附近发生转录早期终止。
陈飞团队在分析INTAC的蛋白互作质谱结果时发现，INTAC与一个单链DNA识别复合物SOSS（Sensor of Single-Strand DNA）存在非常强的相互作用。SOSS在之前的研究中被发现主要在DNA damage repair中起作用。研究者通过一系列体内外的生物化学以及基因组学等实验手段证明了SOSS-INTAC复合物在染色质上的稳定存在。
进一步的研究发现，SOSS-INTAC复合物主要结合在基因的启动子区域。SOSS中的ssDNA识别蛋白会诱导SOSS-INTAC与ssDNA结合，并促进SOSS-INTAC复合物在染色质上的招募及发挥转录早期终止的功能。机制研究表明，SOSS-INTAC在染色质上的结合依赖于R-loop结构中的ssDNA。识别R-loops之后，SOSS-INTAC通过其RNA核酸内切酶作用诱导转录早期终止，同时协同RNA核酸外切酶exosome和XRN2，防止R-loops的过度积累，从而实现维持基因组稳定性的功能。最后，研究者还发现SOSS-INTAC在细胞内以生物大分子凝聚体的形式存在，并且这种凝聚体被破坏后会显著影响SOSS-INTAC调控R-loops和基因组稳定性的能力。
综上所述，该研究论文首次鉴定了一个基因转录和基因组稳定性调控复合物SOSS-INTAC，并揭示了其在基因转录调控和基因组稳定性维持中的“双重质控”功能，是基因转录与基因组稳定性交叉研究领域的又一突破性发现。
