原致远研究组建立空间组学数据库和快速读取方法

作者:张一帆摄影: 视频: 来源:《复旦》校报发布时间:2023-03-18

复旦大学类脑人工智能科学与技术研究院原致远青年副研究员与德州大学达拉斯分校张奇伟教授、腾讯人工智能实验室姚建华博士合作的最新研究成果,支持用户快速浏览、可视化、读取、处理感兴趣的空间组学数据,以《SODB促进空间组学数据的全面探索》(“SODB facilitates comprehensive exploration of spatial omics data”)为题在《自然·方法》(Nature Methods)发表。

该数据库提供来自26种空间组学技术,数据量超过5000万细胞(spot)。目前可通过以下网站公开访问:[https://gene.ai.tencent.com/SpatialOmics/];Python包[https://github.com/TencentAILabHealthcare/pysodb]

本课题共同通讯作者是复旦大学类脑人工智能科学与技术研究院原致远(兼第一作者)、腾讯AI Lab姚建华博士、德州大学达拉斯分校张奇伟教授;清华深研院潘文韬为共同第一作者。

原文链接:

https://www.nature.com/articles/s41592-023-01773-7 


制图:实习编辑:责任编辑:

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