为加强全校新型冠状病毒肺炎防控工作，学校强化突发公共卫生事件联防联控、联处联报工作机制，全面落实防控举措，坚决防止疫情扩散蔓延，确保广大师生健康安全。校党委常委会日前举行电话会议，学习传达中央和全市统筹推进疫情防控和经济社会发展工作会议精神，传达教育部党组会议具体部署。会议强调，要奋力夺取疫情防控和实现全年发展改革目标的双胜利，并研究部署了下一阶段重点工作：要坚决打赢疫情防控阻击战；要坚决打好开学教学攻坚战；要坚决打好网络思政攻坚战；要坚决打好服务国家攻坚战；要坚决打好“十三五”收官攻坚战；要坚决打好治理稳定主动战。
1月22日
学校成立了校党委书记焦扬、校长许宁生担任组长的防控工作领导小组，常务副校长、上海医学院院长桂永浩担任组长的专项工作组和校党委副书记、上海医学院党委书记袁正宏担任组长的专家组，并召开了第一次会议。校党政主要领导第一时间作出指示，要全面落实防控举措，坚决防止疫情扩散蔓延。
1月22、23日
学校连续发布两个通知，就加强新型冠状病毒感染的肺炎防控有关工作进行部署。
1月23日
学校召开第二次专题会议，学习传达贯彻中央有关精神，以及教育部、上海市委市政府和市教卫工作党委工作要求，研究部署学校防控工作。焦扬主持会议。
1月26日
学校召开新型冠状病毒肺炎疫情防控领导小组会议，认真学习贯彻习近平总书记关于新型冠状病毒肺炎疫情防控工作的重要讲话精神和中央领导小组要求，落实教育部、上海市有关工作部署，对学校疫情防控工作再动员、再部署、再加强。焦扬主持会议并讲话。校长许宁生，常务副校长桂永浩、金力，党委副书记袁正宏、许征、尹冬梅，副校长陈志敏、张人禾、徐雷以及相关工作部门负责同志出席会议。
焦扬指出，正月初一，习近平总书记在中共中央政治局常务委员会会上作重要讲话，为我们做好疫情防控工作指明了方向，提供了根本遵循。全校要坚决贯彻、全面落实党中央“全面动员、全面部署、全面加强工作”的决策部署，领导干部要做到“及时发声指导，及时掌握疫情，及时采取行动”，深刻理解“六个加强”的工作部署。必须切实把师生生命安全和身体健康放在第一位。许宁生表示，疫情防控工作要做到早谋划、早部署，要不断提升站位，树立信心，坚决把这一仗打好。复旦大学要有使命担当，科研上要以解决问题为最终目标，需要紧急启动的，学校支持立即启动。要充分认识目前面临的复杂形势，决不能掉以轻心，坚决把党中央各项决策部署落到实处。要及时回应学生的关切，取得教师的理解和支持，全力做好疫情防控的物质保障。
2月3日
学校又以电话会议形式，召开防疫工作领导小组第二次全体会议暨党委常委会扩大会议，贯彻落实中央和教育部、上海市委市政府要求，研究部署当前全校疫情防控工作。焦扬主持会议并讲话，要求全校把打赢抗疫阻击战作为当前压倒一切的重大政治任务，上下一心、众志成城、全力以赴、共克时艰，以最大决心、用最严举措、尽最大努力，守护复旦校园和师生健康。会上，许宁生传达市政府工作会议精神和市教卫工作党委的要求，部署学校疫情防控工作。桂永浩就下一步加强提升疫情防控工作具体举措作了布置。全体校领导逐一交流通报各条线疫区防控工作情况。上海医学院相关领导、学校相关部门负责同志40余人参加电话会议。
2月5日
全校分党委书记电话会议召开。焦扬主持会议并讲话。她指出，现在是抗疫斗争的关键时刻，全校要紧密团结在以习近平同志为核心的党中央周围，以最大决心、最严举措、最大努力，守护好师生健康和校园安全，打赢这场防疫阻击战。焦扬指出，全校要重心下沉，从寒假模式转入工作模式、从一般模式转入攻坚模式。各二级党组织要立即全面投入抗疫斗争，切实担负起“中场线”政治核心和组织领导责任，906个党支部必须承担起“生命线”主体责任、发挥战斗堡垒作用，18000余名党员必须发挥先锋模范作用、冲在防控第一线，团结带领广大师生共同奋斗。
2月11日
学校以视频会议的形式，召开全校党政干部会议，学习贯彻习近平总书记关于疫情防控的系列重要讲话和批示指示精神，落实中央和教育部党组、上海市委市政府疫情防控工作各项要求，对做好学校下一阶段疫情防控工作进行再动员、再部署，通报开学准备、人员返岗工作以及春季学期教学科研、国际合作和港澳台工作方案的制定原则和主要内容。
当天，焦扬、许宁生共同署名发出“致复旦大学全体在鄂师生的一封信”。信中写道，老师们、同学们的健康安危、一举一动，无时无刻不牵动着每一位复旦人的心。我们盼着团聚，更盼大家平安。病毒隔开了我们的物理距离，但隔不开我们的关爱期盼，学校永远是大家温暖的家园和坚强的后盾。
2月17日
学校以网络电话会议形式，召开党委常委会、校长办公会暨疫情防控工作领导小组第四次会议，传达学习习近平总书记在中央政治局常委会会议上关于当前疫情形势和做好下一步疫情防控工作的重要讲话精神，并深入讨论了疫情防控和开学准备等工作。
2月25日
校党委常委会召开电话会议，学习传达中央和全市统筹推进疫情防控和经济社会发展工作会议精神，传达教育部党组会议具体部署。会议强调，要奋力夺取疫情防控和实现全年发展改革目标的双胜利，并研究部署了下一阶段重点工作：要坚决打赢疫情防控阻击战；要坚决打好开学教学攻坚战；要坚决打好网络思政攻坚战；要坚决打好服务国家攻坚战；要坚决打好“十三五”收官攻坚战；要坚决打好治理稳定主动战。
