为大力实施创新驱动发展战略，加快建设具有全球影响力的科技创新中心，鼓励全社会参与科普，提高市民科学素质，营造创新创业的良好氛围，上海市科委启动2016年度上海市“科技创新行动计划”科普项目申报工作，项目包括：科普内容、科普活动两类。
经过层层评审、激烈竞争，基础医学院“基于多模态图像的人脑形态3D展示和互动系统研制”、“心（脑）血管疾病的病理知识科普”两个项目顺利中标。
“基于多模态图像的人脑形态3D展示和互动系统研制”项目由基础医学院人体解剖与组织胚胎学系李文生教授领衔，该项目立足于脑解剖、脑影像等形态特征，利用计算机技术，化繁为简，形象生动地重建脑组织，使社会大众直观有效的了解脑的复杂结构；“心（脑）血管疾病的病理知识科普”项目由基础医学院病理学系吴慧娟老师主持，该活动致力于以病理学专业视角向社会大众推广心（脑）血管常见病的医学知识，提高人们的健康意识。
长期以来，基础医学院积极组织相关系室、重点实验室面向大众开放，宣传医学科普知识，2015年，以人体解剖与组织胚胎学系的人体科学馆和病理学系的病理标本博物馆为基础组建的人体科学科普教育基地成功获批“上海市科普教育基地”。
