海量数据在此汇聚,碰撞医学科研火花

作者:石柳、张欣驰摄影: 视频: 来源:《复旦》校报发布时间:2023-10-08

在医学领域,随着人工智能与医学的深度融合,智能医学成为医学前沿发展方向之一。2019年,作为上海医学院公共技术平台的子平台之一,医学科研数据中心依托高水平地方高校建设项目立项申报获批,并于2020年正式启动建设。20226月,复旦大学智能医学研究院筹集成立,医学科研数据中心作为研究院的一项核心建设内容,在“双一流”和高水平地方高校建设项目的合力支持下继续推进,为医学学科和医学科研的发展持续不断地提供强劲的助推力。

在复旦上医图文信息楼11楼,“医学科研数据中心”的标牌赫然醒目。每天,海量数据在此汇聚交互,碰撞出科研成果的火花。

强大硬件保障算力

“大数据、人工智能”已成当今社会的高频词,大数据也驱动着整个医学的发展,如今,医学研究所涉及的数据正呈现几何式增长,医学科研迫切需要高性能计算平台。

据医学科研数据中心负责人吴飞珍介绍,中心主要面向复旦上医(包括附属医院)师生提供高性能的科学计算服务,实现医学科研数据互联互通。可应对高密度、大数据的计算任务,对多模态、海量的生物医学数据进行深入挖掘和应用,为医学人才培养和科研项目实施提供基础性支撑服务。

通过“双一流”建设项目和高水平地方高校建设项目的重点投入,医学科研数据中心建立了计算平台管理系统。平台峰值计算能力达1027万亿次/秒,其中GPU峰值算力达780万亿次/秒。

强大的计算能力,可以很好地支持科研人员的前沿研究需求。自上线运行至今,该平台累计完成作业33万个以上,用户将近1120名,科研团队30支以上,支撑了大量的科研项目,在全国医学院校大数据平台建设中走在前列。

适配多样科研需求

未来,大数据在医学科研领域潜力无限。目前,中心正在着手推进“隐私计算”项目。以往出于保护隐私的考量,临床病例数据在各个医院分散,其科研价值难以挖掘。而有了中心平台,相当于将分散的本地数据联网到一个“黑箱子”中,既保护个人隐私,又盘活数据资源。“黑箱子”会按照研究者设定的规则对大数据进行分析。整个过程结束后,清除数据痕迹,结论则共享给科研人员。

同时,该平台还在AI制药”的道路上探索行进。药物研发要找到合适的小分子,好比从一堆杂乱的拼图中找到与靶点蛋白口袋正好契合的拼图,靠人工筛选耗时耗力。今后,中心平台将基于知识库和模型发掘潜在的药物靶点,预测靶点与潜在小分子之间的相互作用,提高药物研发成功率。

据悉,复旦上医充分利用综合性大学办学优势,将智能医学确定为“十四五”时期领先布局推进的学科新增长点。依托智能医学研究院,未来复旦上医智能医学学科将继续扎根基础医学、临床医学与信息技术的交叉跨界与融合,以新学科和新平台为创新孵化载体,引育具有全球视野、创新精神和实践能力的医工复合型领军人才和医学拔尖创新人才,同时兼顾科学创新和技术服务,提升数据整合与转化利用能力,推进大数据驱动的知识发现及转化应用,引领新医科的发展。

如有数据中心平台访问和使用需求,可访问网址:http://imi.fudan.edu.cn


制图:实习编辑:责任编辑:

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